Αρνητικά γνωμοδοτούν το Ινστιτούτου Αλιευτικής Έρευνας ( ΙΝ.ΑΛ.Ε) και το Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών ( ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε ) για την εγκατάσταση υπεράκτιων αιολικών πάρκων στο Θρακικό Πέλαγος.
Τις απαντήσεις των δύο φορέων έλαβε ο Δήμος Σαμοθράκης, κατόπιν επιστολής, που απέστειλε σε αυτούς ο Δήμαρχος του νησιού κ. Αθανάσιος Βίτσας.
Συγκεκριμένα, στη γνωμοδότηση του ΕΛ.ΚΕ.Θ.Ε. αναφέρεται ότι οι θαλάσσιες περιοχές στις οποίες σχεδιάζεται η εγκατάσταση του υπεράκτιου αιολικού πάρκου εμπίπτουν σχεδόν εξολοκλήρου ή εν μέρει σε περιοχές του Δικτύου Natura 2000, ενώ στη γνωμοδότηση του ΙΝ.ΑΛ.Ε. επισημαίνεται ότι τα Θαλάσσια Αιολικά Πάρκα θα δεσμεύσουν πολύτιμο χώρο από τα αλιευτικά πεδία του Θρακικού πελάγους, καλύπτοντας σχεδόν εξολοκλήρου τα εθνικά ύδατα που αντιστοιχούν στον Ν. Έβρο.